Montagem E Curadoria De Banco De Dados De Sequencias Nucleotidicas E Proteicas E Construcao De R

Título:
MONTAGEM E CURADORIA DE BANCO DE DADOS DE SEQUÊNCIAS NUCLEOTÍDICAS E PROTEICAS, E CONSTRUÇÃO DE REDES COMPLEXAS

Autores:
CHARBEL EL-HANI, PAULO SOUZA, PEDRO HENRIQUE SOUZA DEANDRADE

Descrição:
A origem das mitocôndrias é um evento que alterou toda a biosfera. Existem muitas hipóteses sobre esse evento, no entanto não há um consenso sobre qual é o grupo-irmão da mitocôndria. Em 2015, Carvalho et al. publicaram uma nova hipótese sobre a origem das mitocôndrias, sustentando que o grupo-irmão das mitocôndrias seria todo o grupo da alphaproteobacteria, com exceção da ordem Rickettsiales. No mesmo ano, Wang e Wu apontaram para as famílias Anaplasmataceae e Rickettsiaceae como grupos-irmãos das mitocôndrias. Atualmente, existe a hipótese de que todo o clado das Alfaproteobactérias seria grupo‐irmão das mitocôndrias (MARTIJN et al., 2018). O objetivo deste trabalho foi dar continuidade aos estudos sobre a origem evolutiva das mitocôndrias com sequências proteicas e nucleotídicas, usando banco de dados usados por Martijn et al. (2018). Este estudo se iniciou com uma etapa de curadoria de dados e posteriormente empregou-se uma metodologia de análises de redes complexas. Foi realizada a análise de modularidade de redes de sequências proteicas ou de DNA. Os nós são sequências de aminoácidos de proteínas ou sequências de DNA encontradas e as arestas são estabelecidas a partir de um coeficiente de identidade, montando-se 101 redes a partir de coeficientes de identidade variando de 1 a 100%. Foi realizada a seleção, a partir de uma métrica de distância, da rede com a melhor relação entre sinal e ruído filogenético. Os resultados obtidos até o momento apontam que as mitocôndrias tiveram origem antes da diversificação das alphaproteobacterias, coincidindo com a proposta feita por Martjin e colaboradores.

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Author

Ariyani

Como educador, estou profundamente engajado no desenvolvimento dos estudantes em ambiente escolar, adotando métodos pedagógicos que valorizam conexões genuínas e são movidos por inovação e fervor. É minha vocação guiar os alunos na jornada de se tornarem uma geração notável, empregando estratégias de ensino amplamente aclamadas por prestigiadas instituições acadêmicas ao redor do globo - events.zulekhahospitals.com